|
Astronomický snímok dňa 
|
|
|
 |
| |
|
Zobrazujem príspevky 1 až 5 z celkového počtu 2 (strana 1 z 1)
|
Prednedavnom som zalozil team BOINC.SK pod japonskymi projektami, uz som aj uspesne zratal zopar jednotiek z projektu Chronos. Zatial som jediny aktivny ucastnik, ale dufam, ze sa onedlho pridaju aj dalsi :-), tieto projekty su vedecky uzitocnejsie ako napr. Protein Predictor. Podrobny navod a blizsie info k zapojeniu budu k dispozicii onedlho. A don`t worry, nebudete musiet vediet ani znak po japonsky, aj ked stranky aj boinc clint su len v japoncine - vsetko vysvetlime.. :-)
|
| |
|
To je uplne samozrejme, ved som napisal, ze k tomu bude navod. :-) Vcera som bol v Tokyu, zajtra zas budem v Hiroshime, takze to nebude hned..
|
|
|
| |
|
Hodil by sa k tomu nejaky popis ako sa pripadne do tychto projektov zapojit, po letmom pohlade na ten japonsky web mi to moc nedochadza :).
|
|
|
| |
|
Ani - ani. :-)
Projekty maju vyse dvetisic ucastnikov a cca dvesto timov. Mimo Japonska je vsak (z pochopitelnych dovod :-) ) len zopar desiatok ludi. Takze sam som zatial len v nasom time (okrem jedneho virtualneho ucastnika "slovak_member" ktoreho som zalozil tiez ja, ale len na overenie ako sa novy ucastnik zapoji do existujuceho timu - kedze je to len v japoncine, chcel som si overit ci som to vsetko pochopil spravne)...
|
|
|
| |
|
"..zatial som jediny aktivny ucastnik.." - jediny vobec alebo jediny ako jediny mimo Japoncov? :)
|
|
|
|
Japonske Boinc projekty narozdiel od niektorych inych naozaj funguju a vyzera, ze sa pekne rozvijaju a ziju. Holt, japonci su proste makaci a ked nieco zacnu tak na tom aj robia, to je ta pozitivna stranka stresoveho japonskeho zivota... Odkaz na ich projekty sa uz objavil aj na homepagei Boincu (pod odrazkou Cell computing).
Nepaci sa mi, ze
- stale maju nestandardny boinc soft
- nemaju stranky v anglictine
Paci sa mi, ze (sice v japoncine, ale) maju najpodrobnejsie info o tom, co sa rata, spomedzi vsetkych tych life science projektov, ktore sa vyrojili.
Kedze nepredpokladam, ze vela z vas ma nervy borit sa s kostrbatym prekladom z japonciny, par viet by som zhrnul.
Zaujimave je napr. to, ze projekt BOLERO sa zaobera vztahom genov a imunitnej reakcie organizmu, inymi slovami aj evoluciou genov zodpovednych za produkciu antibakterialnych latok v bunkovej membrane/povrchu (specialna struktura vybudovana z peptidov/cukrov).
Projekt PROSURFER pocita podobnost povrchov proteinov, co je dolezite pri ich funkcnosti - proteiny totiz funguju najma na zaklade elektrostastickych interakcii medzi nimi a bunecnou strukturou, ktore do velkej miery zavisia na povrchovej podobnosti proteinov. Vyvinutim vhodneho softu na porovnavanie povrchov proteinov teda mozme odhalit nove funcie proteinov ktore sme doteraz nepoznali, a teda vyrobit z tychto proteinov ucinne lieky na choroby na ktore sa doteraz vobec z nevedomosti nepozivali. Pre porovnanie (i ked nie z proteinoveho sudka) - podobnost molekularnej povrchovej a geometrickej struktury ma napr. za nasledok psychotropne ucinky LSD, ktora je podobna prirodzenym neurotransmiterom v mozgu, zaujme teda ich miesto a "pokrivi" vase vnimanie reality, ktora je za normalnych podmienok "kodovana" ci "pokrivena" len prostrednictvom serotoninu a dalsich asi dvesto neurotransmiterov prirodzene sa vyskytujucich v nasom mozgu.
Projekt ELECLE viac menej sluzi na to, aby sa biologicke distributed computing veci stali aj graficky a uzivatelsky pritazlive, ide o renderovanie kratkych filmov ci animacii pre verejnost. Tiez uzitocna vec podla mna, na ktoru ine life science projekty (na ich skodu) zabudaju.
Projekt CHRONOS (vidiet ze japonci maju znalosti aj o nasej zapadnej mytologii :-) ) ma za ulohu vypocitat vztah medzi genmi v chromozomoch a ich kombinaciami a roznymi genetickymi chorobami, ako napr. geneticka nachylnost na vznik rakoviny (to suvisi najma s tym, ked vase telo ma vdaka nevhodnej kombinacii genov problem vyrabat iste druhy enzymov), ci cukrovky.
Je to zaujimave z toho dovodu, ze sa sustreduje nie na samotne proteiny (ako napr. predictor) ale priamo na povod celeho problemu - identifikacie genov ktore tieto problemy sposobuju. Okrem toho, ako mozno niektori viete, nedavno sa podarilo kompletne zmapovat cely ludsky genom (to znamena poradie upne vsetkych genov, ktore vytvaraju ludsku DNA molekulu a teda koduju celeho cloveka). To je obrovsky uspech, problem je zatial v tom, ze mame sice kompletne poradie nasich genov (ci presnejsie ich casti - nukleotidov), ale pri vacsine z nich zatial nevieme co koduju a naco su dolezite (nehovoriac o tom, ze vacsina nasho genetickeho kodu nekoduje vobec nic dolezite, je to len evolucny zvysok, ktory vsak je velmi uzitocny pri odolnosti voci novym zmenam prostredia a je pricinou napr. odolnosti bakterii voci antibiotikam). Mame teda obrovsky zoznam zakodovanej informacie o nasom tele, a musime sa z toho vysomarit - cast z toho (tykajucu sa genetickych chorob) sa snazi rozkodovat prave CHRONOS.
A v neposlednom rade realizovali napad vytvorit hru pod nazvom "bunka a koshi", co je myslim velmi dobry napad ako propagovat myslienku life science a konkretne distribuovanych vypoctov a boinc.
Takze uz len treba dufat, ze japonci to prelozia aj do anglictiny, pretoze tazko ludia mimo japonska budu do toho cumiet a zucastnovat sa, ak to je v cinskych klikoch hakoch prespikovanych japonskymi slabicnymi abecedami, a podla kvality projektov by bola velka skoda keby to zostalo uzavrete len pre japonskych ucastnikov.
|
| |
|
No, mozno to nie je az tak celkom namyslenost, ale skor historicky prezivajuca izolovanost. Je to silna a samostatna krajina, a pocit odstupu a izolacie od cudzincov a ostatneho sveta nie je az tak jednoduche prekonat. To bude asi hlavna pricina preco do toho prilis nezahrnaju cudzincov. Okrem toho, mozno v tom hra rolu aj to, ze sa boja nieco oficialne produkovat v anglictine, jednak preto, ze anglictina robi mnohym japoncom problemy (dokonca aj vedcom), a jednak preto, ze japonci ak nieco davaju do obehu tak to musi byt super dokonale, inak sa zdrahaju to uverejnit. I ked jepravda, ze japonski businessmani ked si vypiju, tak hovoria o tom, ze chcu financne dobyt svet... :-)
|
|
|
| |
|
to duri
vies myslim si ze japonci su v tychto veciach dost namysleni a skusaju si to spravit sami mozno preto to nedali sirsej verejnosti
martin
|
|
|
| |
|
Diky Martin, velmi uzitocna poznamka! Na tej stranke je sice len Chronos, ale v nom bola podstranka s neoficialnym anglickym prekladom vsetkych JP projektov co som spominal. Uz len nerozumiem, preco ich japonski autori nezoficialnia alebo inak nevyuziju, ved zmysel distributed computingu je vyuzit co najvacsiu kapacitu pocitacov...
|
|
|
| |
|
ahoj duri
na tejto stranke su vsetky terajsie a aj minule projekty aj pod boincom aj japonske
|
|
|
| |
|
Len kratka poznamka - aby ste vedeli co to asi "povrch proteinu" znamena, pozrite si tento obrazok. Je to povrch ktory "citi" ina molekula, ktora sa k proteinu blizi alebo s ktorou protein ma interagovat (zavisi od typu tejto molekuly, iny povrch proteinu citi napr. voda a iny alkoholovy roztok). Kedze je to svet malych castic, je to znacne ina vec ako povrch, ktory by si laik ako prvy predstavil - nejedna sa teda o ziadne "gulicky atomov", ale skor nieco co vyzera ako rozliata voda v beztiazovom stave. Suvislost nie je vobec nahodna, povrchove napatie vody a elektrostaticke napatie na povrchu proteinov su si naozaj podobne..
Vypocet tychto elektrostatickych povrchov je dost casovo narocny, aj preto je dobre nan vyuzit Boinc...
|
|
|
|
|
|
 |
|
